Après un diplôme d'ingénieur de conception à l'école Polytechnique de Thiès, au Sénégal, Boubacar Khouma a travaillé dans plusieurs projets de modernisation des grandes administrations, notamment l'élaboration du schéma directeur du premier projet egov en 2001. Puis, en tant que consultant de l'EU, il a travaillé dans l'élaboration de schéma directeur informatique pour plusieurs ministères en Afrique de l'Ouest et du Nord. Depuis 2015, il fournit des services de prestations pour les grands comptes (CAC40) en France en tant qu'expert transverse dans l'infrastructure informatique.